2ノード(MPI) x 2 CPU(12コア) の規模で以下の二種類の計算機(計算サーバ + OPT クラスタ)で比較実験を行った。通信量の多い少ないによって、わかりやすい結果になっている。
◯問題：nug12_r2.dat-s (通信量多い）
計算サーバ + MPICH2 1.4.1p1 (GbE) : 313.41s
計算サーバ + OpenMPI 1.5.4 (Inifiband) : 148.82s
OPT クラスタ + OpenMPI 1.5.4 (Inifiband) : 119.88s
◯問題：FH2+.1A1.STO6G.pqgt1t2p.dat-s（通信量少ない）
計算サーバ + MPICH2 1.4.1p1 (GbE) : 69.74s
計算サーバ + OpenMPI 1.5.4 (Inifiband) : 65.74s
OPT クラスタ + OpenMPI 1.5.4 (Inifiband) : 62.67s
◯ 計算サーバ：Intel Xeon + 4 GPU マシン（２台）
CPU：Xeon X5690(3.46GHz,6コア)×2
メモリ：192GB(16GB×12)
HDD：SATA500GB×2(システム、システムバックアップ)
NIC : GbE x 1 & Inifiniband x 1
GPGPU：Tesla C2075×4
OS：CentOS 6.2
○ OPT クラスタ
１：PowerEdge M1000e(ブレードエンクロージャー) x 1台
２：PowerEdge M710HD(ブレードサーバ) x 16台
ブレードサーバの仕様：
CPU : インテル(R) Xeon(R) プロセッサー X5670(2.93GHz、12MB キャッシュ、6.4 GT/s QPI) x 2個
メモリ： 128GB (16X8GB/2R/1333MHz/DDR3 RDIMM/CPUx2)
Disk : 73GB x 2(1台のみ 300GB x 2)
NIC : GbE x 1 & Inifiniband QDR(40Gbps) x 1
OS : CentOS 5.8
